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Esta historia empezó hace un año y medio. Como parte del proyecto se dió la necesidad de generar una mutante en el gen con el que trabajo. El primer problema inició con la estrategia elegida para construir la copia mutante del gen ya que nos decidimos por una que implicaba traslapar dos productos de PCR independientes en un ciclo extra de elongación. Pues salió a la primera y de hecho pude clonarlo en un vector intermediario casi luego luego. Sin embargo al momento de secuenciar me di cuenta que me había comido el promotor de otro gen acabando así con la funcionalidad de esta construcción. Pues diseñé otro oligo un poco mas alejada para incluir el promotor y a pesar de que si pude generar los dos productos simplemente no fué posible hacer el traslape. Invertí casi un semestre en esta lucha por el traslape y vergonzosamente debo admitir que fuí derrotado y decidí cambiar de estrategia.
La siguiente estrategia consisitó en el ensamble por restricción y ligación el fragmento deletado y su posterior ligación en un vector. Esto fué nuevamente sencillo hasta que secuencié el producto que tenía clonado en el vector suicida y resultó ser algo raro. En algún momento entre el intermediario y el suicida cloné algo que pesqué sepa de donde. Y lo que sucede es que el suicida no estaba funcionando bien y generaba rearrlegos o algo así ya que además le tenía que meter un interposón omega Sp pues la resistencia del suicida era Km al igual que la de la cepa que quería mutar.
Al final he vuelto a construir el gen mutante y lo he clonado de primera intención en un suicida nuevo pero que no tiene contraselección en Sac. Ahora tengo que encontrar la cepa que haya perdido espontaneamente la cointegración del vector. Para eso tenga que estar pique y pique colonias, ya llevo 1300 y tengo 9 candidatas. La foto es de una de esas cajas que estoy picando, ahora multipliquenla por 26 y ese es el tamaño del trabajo que estoy haciendo. Y ni me digan porque son puras probabilidades: Puedo encontrar la mutante a la primera o me puede pasar como a mi tutor en sus tiempos de estudiante: Picó 5000 hasta encontrar una mutante.
Pero mientras checo la mutante sigo picando colonias...

Este viene siendo mi hogar académico. Ahora estoy en la parte final de mi doctorado en el flamantemente renombrado Centro de Ciencias Genómicas (CCG) de la UNAM. El centro fué fundado hace 20 años con el nombre de Centro de Investigación sobré Fijación de NItrógeno (CIFN) y fué la primera entidad foranea de la Universidad Nacional. El campus Morelos de la UNAM está situado en el campus Cuernavaca de la UAEM y está integrado, ademas del CCG, por el Instituto de Biotecnología (IBT), el Centro de Ciencias Físicas (CCF), el Centro Regional de Investigaciones Multidisciplinarias (CRIM) y una estación del Instituto de Matemáticas (IMAT)
En sus inicios el centro se dedicó a estudiar la relación simbiótica de un género de bacterias llamado Rhizobium y plantas leguminosas. En esta relación las bacterias son capaces de tomar el Nitrógeno molecular de la atmosfera y entregarselo a las plantas en forma de compuestos nitrogenados que la planta puede utilizar para hacer proteínas. La bacteria obtiene a cambio de este trabajo alojamiento en la raices y comida.
El trabajo que el centro realizó en el area es de vital importancia en la comprensión y aprovechamiento de este fenómeno y derivó (en una de las aportaciones aplicadas) en el desarrollo de biofertilizantes que incrementan el rendimiento en cosecha al tiempo que disminuyen el requerimiento de fertilizantes nitrogenados.



Como parte de esta línea de investigación surgió en el centro la iniciativa de secuenciar el genoma completo de la rhizobacea que establece relaciones simbióticas con el frijol Rhizobium etli. Esto marcó el inicio del desarrollo de las ciencias genómicas en el centro. Este fué el primer y hasta ahora único genóma secuenciado completamente en México lo que marcó al centro como la punta de lanza en el desarrollo de la genómica en el país. Actualmente se cuenta con infraestructura para hacer secuencia, proteoma y transcriptoma y somos sede de la licenciatura en ciencias genómicas, primera en su tipo en Lationoamérica.



Ana y yo llegamos en el 2000 como parte de un taller de la licenciatura en biología de la H.H. Facultad de Ciencias cuando ibamos a mitad de la carrera. De hecho podemos presumir de haber sido los primeros alumnos de licenciatura en México en haber tomado un taller de genómica. No estamos en el mismo laboratorio pues nuestros intereses científicos son diferentes aunque mi poryecto ha dado algunos giros y ahora trabajo en colaboración con los tutores de Ana.
Apenas hace unas semanas acabamos de cambiar de director y hay alguna tensión en los alumnos de posgrado pues tenemos ciertas dudas sobre el plan de desarrollo del centro. Afortunadamente como en casi toda la UNAM hay un espiritú de conciliación y esperamos resolver estos detalles a la brevedad.
De mi proyecto, mi tutor y la gente hablaré en otra ocasión porque este texto ya está tomando dimensiones bíblicas.
La primera foto es la fachada del centro y las otras dos son diferentes planos de mi basurero.... eh mi lugar.

Por si no quedó claro Odín es mi perro no mi hijo, tampoco soy tan cruel como para ponerle a un niño ese nombre.
La historia de como llegó Odín a mi vida es esta:
Un día apareció en el estacionamiento del centro. Estaba ahí echado y cada vez que alguien se acercaba se levantaba meneando la cola y jugeteaba un momento. Así estuvo un par de días y pronto se volvió un personaje muy querido por todos por su actitud tan sociable y su apariencia tan tierna (Nomas vean la foto). Como al tercer día ana y yo salimos muy noche y ahí estaba. Cuando nos vió, fiel a su rutina, se levantó y se acercó a nosotros meneando su cola (Su forma de menear la cola es bastante curiosa ya que esta se mueve junto con la mitad de su cuerpo). Cuando abrí la cajuela del coche para meter las mochilas trepó las patas delanteras a la cajuela y me volteó a ver como diciendo: "Ya nos vamos?". Fue todo para mí, voltee a ver a Ana y le pregunté: "Nos lo llevamos?". Ana Laura asintió, así que lo cargué y lo subí al coche. Fuimos al super por unas croquetas y como lo ví chiquito pues le compré una bolsita de croquetas para cachorro.



Al día siguiente lo llevé al veterinario y resultó que mangos que no estaba cachorro, que tenía 2 años, que estaba en perfecto estado y que solo tenía una garrapata pegada. Lo vacunaron, lo bañaron y me entregaron a mi hijo. También me preguntaron que como se llamaba. Orale pues no se me había ocurrido!!! Una gran variedad de nombres cruzaron mi cabeza, todos los clasicos nombres que un biólogo mamila le pone a su perro: Darwin, Lamark, Watson, etc... Pero yo no, yo decidí ser original y le puse Odin..... Como mi primer perro. Odín fue un weimaraner sobre alimentado que tuve cuando era niño y odín es mi Collie de Cuernavaca (la raza de mi perro según lo decidí).
Eso fué hace ya dos años, en ese tiempo nos domesticamos mutuamente y vivimos muchas cosas que contaré poco a poco. Hoy ya tiene cuatro años y simplemente lo amo.