Buscando la Mutante

Esta historia empezó hace un año y medio. Como parte del proyecto se dió la necesidad de generar una mutante en el gen con el que trabajo. El primer problema inició con la estrategia elegida para construir la copia mutante del gen ya que nos decidimos por una que implicaba traslapar dos productos de PCR independientes en un ciclo extra de elongación. Pues salió a la primera y de hecho pude clonarlo en un vector intermediario casi luego luego. Sin embargo al momento de secuenciar me di cuenta que me había comido el promotor de otro gen acabando así con la funcionalidad de esta construcción. Pues diseñé otro oligo un poco mas alejada para incluir el promotor y a pesar de que si pude generar los dos productos simplemente no fué posible hacer el traslape. Invertí casi un semestre en esta lucha por el traslape y vergonzosamente debo admitir que fuí derrotado y decidí cambiar de estrategia.
La siguiente estrategia consisitó en el ensamble por restricción y ligación el fragmento deletado y su posterior ligación en un vector. Esto fué nuevamente sencillo hasta que secuencié el producto que tenía clonado en el vector suicida y resultó ser algo raro. En algún momento entre el intermediario y el suicida cloné algo que pesqué sepa de donde. Y lo que sucede es que el suicida no estaba funcionando bien y generaba rearrlegos o algo así ya que además le tenía que meter un interposón omega Sp pues la resistencia del suicida era Km al igual que la de la cepa que quería mutar.
Al final he vuelto a construir el gen mutante y lo he clonado de primera intención en un suicida nuevo pero que no tiene contraselección en Sac. Ahora tengo que encontrar la cepa que haya perdido espontaneamente la cointegración del vector. Para eso tenga que estar pique y pique colonias, ya llevo 1300 y tengo 9 candidatas. La foto es de una de esas cajas que estoy picando, ahora multipliquenla por 26 y ese es el tamaño del trabajo que estoy haciendo. Y ni me digan porque son puras probabilidades: Puedo encontrar la mutante a la primera o me puede pasar como a mi tutor en sus tiempos de estudiante: Picó 5000 hasta encontrar una mutante.
Pero mientras checo la mutante sigo picando colonias...
Comentario:
Mira nomás a quién me fuí a encontrar en el universo impersonalmente privado de los blogs. Me da gusto saber que stás vivo y bien, aunque realmente creo que no te importa que me de gusto. Creo que el sitio mejorará con una foto tuya en bata (solamente bata). Ya en serio se te ve buen semblante y parece ser que estás feliz. Si te interesa un poquillo sabrás fácilmente quié soy, si no... por lo menos sabrás que hay extraños que te desean lo mejor.
Comentario:
Yuca: Me encantó esta página. Siempre disfruto mucho todos tus relatos, sin embargo el que tengas fotografías aquí, ayuda mucho, porque francamente nunca te entiendo nada. Así por lo menos visualmente ya se de lo que nos hablas.
Tu hijo esta precioso.
Me encanta que te este yendo tan bien!
Un beso y un abrazo, para tí y para Ana.
Tu hijo esta precioso.
Me encanta que te este yendo tan bien!
Un beso y un abrazo, para tí y para Ana.







